Projekt Elektronske znanstvenokritične izdaje slovenskega slovstva Trajanje projekta: 1. julij 2004–30. junij 2007 Vodja projekta: dr. Matija Ogrin Šifra: L6-6373 (B)
Projekt Nacionalne literature, Srednja Evropa, Evropa in svet: metodološki problemi primerjalne literarne vede z vidika slovensko-čeških razmerij Trajanje projekta: 1. maj 2003–1. maj 2005 Vodja projekta: Ivo Pospíšil (Masarykova univerza, Brno) Šifra: BI-CZ/04-05-005
Projekt Znanstvenokritične izdaje v elektronskem mediju Trajanje projekta: 1. julij 2001–30. junij 2004 Vodja projekta: dr. Matija Ogrin Šifra: L6-3083 (B)
Projekt Literarna teorija in primerjalna književnost (problemi in rešitve v češki in slovenski tradiciji ter kontekstih) Trajanje projekta: 10. maj 2001–10. maj 2003 Vodja projekta: Ivo Pospíšil (Masarykova univerza, Brno) Šifra: SLO-ČEŠKI 29/01–03
Projekt Neznani rokopisi slovenskega slovstva 17. in 18. stoletja Trajanje projekta: 1. februar 2008–30. januar 2011 Vodja projekta: dr. Matija Ogrin Šifra: L6-0163 (B)
Projekt Islandski in slovenski kulturni svetniki Trajanje projekta: 29. september 2009–31. december 2010 Šifra: NFM-NFM-45/09
Projekt Primerjalne raziskave češkega in slovenskega literarnega polja v srednjeevropskem kontekstu Trajanje projekta: 1. januar 2007–31. december 2008 Šifra: BI-CZ/07-08-005
Projekt ACUME – Kulturni spomin v evropskih državah: meddisciplinarni pristop Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. oktober 2006 Vodja projekta: Vita Fortunati
Projekt Leksika in potek izoleks v slovenskih narečjih na avstrijskem Koroškem Trajanje projekta: 1. julij 2007–30. junij 2010 Vodja projekta: dr. Matej Šekli Šifra: L6-9052 (B)
Projekt Prepovedane knjige na Slovenskem v zgodnjem novem veku Trajanje projekta: 1. januar 2016–31. december 2018 Šifra: L6-7134 (A)